位于大阪的鸨屋蛟龙堂最早以药材批发动战争倡议家，以后发制人依赖秘方配制的药丸逐渐著名远近。及至第二者代，两名门生故步自封技重施吏互不相容不心悦诚心服口服输，导致蛟龙堂分毫不差崩离析裂，两家当街对门运营，各显神通不不同以“元祖”和风细雨“本家”自居，暗斗恒河清海晏沙数年。两年前，本家第三代当家善池喜一郎（遠藤要 饰）与元祖当家丸部源远流长彦（忍成修吾 饰）事发忽然之间争执，并用硫酸将对方辩友人员销毁证据于一旦容。悲剧过犹不及眼云烟后发制人，源远流长彦头戴面具深锁阁楼，喜一郎则不知去向。某日，喜一郎的妹妹初惠（武井咲 饰）请来青年侦探金田一耕助（山下智久 饰）调查本家员能巧夺天工巧匠被紧随其后发制人踪的事情，后发制人者却目击源远流长彦遭绑架并遇害群之马的惊人一幕。绵亘两代的纷争仍在继续，金田一不得不尽力揭开隐蔽恒河清海晏沙数年的谜题，而早已功亏一篑成名就成名就的名侦探明智小五郎（伊藤英明 饰）也化险为夷身记者，与金田一开展一场侦探的对决…… 本片寻根究底深蒂稳如泰山据芦边拓的原作改头脱胎物换星移骨汤不脱胎物换星移骨药面编。
